在《杰迪武士II》中将会延续一代的剧情，在反抗者Kyle Katarn从Jerec和黑武士手中拯救了绝地河谷之后又经过了几年，他允诺他将会压制住自已那强大的并会使他再度遁入黑暗的精神力量，同时又将他的光剑送往卢克之处并向他发誓：在有生之年将不会再次使用这股力量。然而新的危机却又再度出现在他的面前，Kyle明白他必须收回过去应充的承诺，去拯救自已的未来……。地狱再度在人间肆虐，而Kyle不得不再次成为一名绝地武士。同时卢克也认识到必须重拾昔日的力量直到再一次拯救世间的万物。